Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THSD1Q9NS62 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THSD1Q9NS62 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
THSD1Q9NS62 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THSD1Q9NS62 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THSD1Q9NS62 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THSD1Q9NS62 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms