Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB16Q9NRJ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCDHB16Q9NRJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB16Q9NRJ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHB16Q9NRJ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHB16Q9NRJ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms