Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms