Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PALMDQ9NP74 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PALMDQ9NP74 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALMDQ9NP74 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALMDQ9NP74 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALMDQ9NP74 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms