Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA4AQ9H3S1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA4AQ9H3S1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA4AQ9H3S1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA4AQ9H3S1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEMA4AQ9H3S1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA4AQ9H3S1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA4AQ9H3S1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA4AQ9H3S1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA4AQ9H3S1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA4AQ9H3S1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA4AQ9H3S1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA4AQ9H3S1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms