Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VCXQ9H320 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VCXQ9H320 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VCXQ9H320 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCXQ9H320 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCXQ9H320 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCXQ9H320 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms