Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CEP44Q9C0F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP44Q9C0F1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP44Q9C0F1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CEP44Q9C0F1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP44Q9C0F1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP44Q9C0F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP44Q9C0F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP44Q9C0F1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CEP44Q9C0F1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms