Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR2

KRTAP4-5, Keratin-associated protein 4-5, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRTAP4-5Q9BYR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP4-5Q9BYR2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP4-5Q9BYR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRTAP4-5Q9BYR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KRTAP4-5Q9BYR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms