Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB6Q9BUF5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB6Q9BUF5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TUBB6Q9BUF5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBB6Q9BUF5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBB6Q9BUF5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms