Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
IFT140Q96RY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
IFT140Q96RY7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
IFT140Q96RY7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
IFT140Q96RY7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
IFT140Q96RY7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
IFT140Q96RY7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
IFT140Q96RY7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
IFT140Q96RY7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
IFT140Q96RY7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
IFT140Q96RY7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
IFT140Q96RY7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
IFT140Q96RY7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
IFT140Q96RY7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.42■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
IFT140Q96RY7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
IFT140Q96RY7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
IFT140Q96RY7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC44.22■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
IFT140Q96RY7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
IFT140Q96RY7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.09■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
IFT140Q96RY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
IFT140Q96RY7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.98■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
IFT140Q96RY7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms