Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TGS1Q96RS0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TGS1Q96RS0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TGS1Q96RS0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TGS1Q96RS0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TGS1Q96RS0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TGS1Q96RS0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms