Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
INPP4AQ96PE3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INPP4AQ96PE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INPP4AQ96PE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
INPP4AQ96PE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
INPP4AQ96PE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms