Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAP1Q96NZ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAP1Q96NZ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAP1Q96NZ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAP1Q96NZ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRAP1Q96NZ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAP1Q96NZ9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRAP1Q96NZ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAP1Q96NZ9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms