Protein–RNA interactions for Protein: Q96KH6

C18orf12, Uncharacterized protein C18orf12, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf12Q96KH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf12Q96KH6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf12Q96KH6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf12Q96KH6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf12Q96KH6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf12Q96KH6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C18orf12Q96KH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms