Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS50Q96JG6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS50Q96JG6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS50Q96JG6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS50Q96JG6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS50Q96JG6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms