Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEIL1Q96FI4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEIL1Q96FI4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEIL1Q96FI4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEIL1Q96FI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEIL1Q96FI4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms