Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MFSD3Q96ES6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MFSD3Q96ES6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MFSD3Q96ES6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MFSD3Q96ES6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MFSD3Q96ES6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms