Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSI2Q96DH6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSI2Q96DH6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSI2Q96DH6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSI2Q96DH6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSI2Q96DH6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms