Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB39BQ96DA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB39BQ96DA2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB39BQ96DA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB39BQ96DA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB39BQ96DA2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms