Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TIFAQ96CG3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIFAQ96CG3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIFAQ96CG3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TIFAQ96CG3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TIFAQ96CG3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TIFAQ96CG3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIFAQ96CG3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TIFAQ96CG3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIFAQ96CG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TIFAQ96CG3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TIFAQ96CG3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms