Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C3orf49Q96BT1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C3orf49Q96BT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf49Q96BT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf49Q96BT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf49Q96BT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms