Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CLUAP1Q96AJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLUAP1Q96AJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CLUAP1Q96AJ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CLUAP1Q96AJ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CLUAP1Q96AJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CLUAP1Q96AJ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLUAP1Q96AJ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLUAP1Q96AJ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CLUAP1Q96AJ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLUAP1Q96AJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CLUAP1Q96AJ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLUAP1Q96AJ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CLUAP1Q96AJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms