Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFT1Q96AA3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFT1Q96AA3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFT1Q96AA3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFT1Q96AA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms