Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCLNQ969V3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCLNQ969V3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCLNQ969V3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCLNQ969V3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLNQ969V3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms