Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP7Q93009 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP7Q93009 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP7Q93009 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP7Q93009 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP7Q93009 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP7Q93009 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP7Q93009 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP7Q93009 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP7Q93009 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP7Q93009 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP7Q93009 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP7Q93009 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP7Q93009 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP7Q93009 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP7Q93009 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP7Q93009 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP7Q93009 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP7Q93009 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP7Q93009 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP7Q93009 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP7Q93009 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP7Q93009 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP7Q93009 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP7Q93009 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP7Q93009 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP7Q93009 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP7Q93009 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP7Q93009 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP7Q93009 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP7Q93009 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP7Q93009 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP7Q93009 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP7Q93009 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP7Q93009 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP7Q93009 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP7Q93009 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP7Q93009 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP7Q93009 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP7Q93009 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP7Q93009 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP7Q93009 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP7Q93009 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP7Q93009 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP7Q93009 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP7Q93009 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP7Q93009 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP7Q93009 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP7Q93009 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP7Q93009 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP7Q93009 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP7Q93009 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP7Q93009 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP7Q93009 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP7Q93009 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP7Q93009 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP7Q93009 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP7Q93009 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP7Q93009 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP7Q93009 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP7Q93009 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP7Q93009 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP7Q93009 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP7Q93009 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP7Q93009 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP7Q93009 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP7Q93009 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP7Q93009 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP7Q93009 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP7Q93009 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP7Q93009 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP7Q93009 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP7Q93009 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP7Q93009 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP7Q93009 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP7Q93009 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP7Q93009 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP7Q93009 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP7Q93009 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP7Q93009 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP7Q93009 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP7Q93009 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP7Q93009 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP7Q93009 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP7Q93009 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP7Q93009 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP7Q93009 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP7Q93009 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP7Q93009 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP7Q93009 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP7Q93009 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP7Q93009 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP7Q93009 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP7Q93009 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP7Q93009 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP7Q93009 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP7Q93009 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP7Q93009 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP7Q93009 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP7Q93009 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms