Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GATA6Q92908 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GATA6Q92908 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GATA6Q92908 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GATA6Q92908 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GATA6Q92908 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms