Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMPDL3BQ92485 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMPDL3BQ92485 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMPDL3BQ92485 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPDL3BQ92485 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPDL3BQ92485 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms