Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PALLDQ8WX93 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PALLDQ8WX93 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
PALLDQ8WX93 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PALLDQ8WX93 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PALLDQ8WX93 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PALLDQ8WX93 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PALLDQ8WX93 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PALLDQ8WX93 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PALLDQ8WX93 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PALLDQ8WX93 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.76■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PALLDQ8WX93 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PALLDQ8WX93 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PALLDQ8WX93 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PALLDQ8WX93 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms