Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APCDD1LQ8NCL9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APCDD1LQ8NCL9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APCDD1LQ8NCL9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APCDD1LQ8NCL9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APCDD1LQ8NCL9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms