Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT2

TDRD5, Tudor domain-containing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TDRD5Q8NAT2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD5Q8NAT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD5Q8NAT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TDRD5Q8NAT2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TDRD5Q8NAT2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD5Q8NAT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD5Q8NAT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD5Q8NAT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD5Q8NAT2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD5Q8NAT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD5Q8NAT2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD5Q8NAT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms