Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTUD6BQ8N6M0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
OTUD6BQ8N6M0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTUD6BQ8N6M0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OTUD6BQ8N6M0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OTUD6BQ8N6M0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms