Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CADM3Q8N126 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CADM3Q8N126 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CADM3Q8N126 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CADM3Q8N126 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CADM3Q8N126 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM3Q8N126 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CADM3Q8N126 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms