Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWN7

RP1L1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1L1Q8IWN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RP1L1Q8IWN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RP1L1Q8IWN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1L1Q8IWN7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1L1Q8IWN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP1L1Q8IWN7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP1L1Q8IWN7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RP1L1Q8IWN7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RP1L1Q8IWN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1L1Q8IWN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms