Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNEQ86WN2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFNEQ86WN2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNEQ86WN2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNEQ86WN2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNEQ86WN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms