Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
N4BP2Q86UW6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
N4BP2Q86UW6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
N4BP2Q86UW6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
N4BP2Q86UW6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
N4BP2Q86UW6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
N4BP2Q86UW6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
N4BP2Q86UW6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms