Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDB1Q86U70 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LDB1Q86U70 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LDB1Q86U70 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB1Q86U70 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LDB1Q86U70 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB1Q86U70 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms