Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms