Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
STRCQ7RTU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
STRCQ7RTU9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
STRCQ7RTU9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
STRCQ7RTU9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
STRCQ7RTU9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
STRCQ7RTU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
STRCQ7RTU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
STRCQ7RTU9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCQ7RTU9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms