Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC36A4Q6YBV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC36A4Q6YBV0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC36A4Q6YBV0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC36A4Q6YBV0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC36A4Q6YBV0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC36A4Q6YBV0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms