Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMCO3Q6UWJ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMCO3Q6UWJ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO3Q6UWJ1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCO3Q6UWJ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMCO3Q6UWJ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO3Q6UWJ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms