Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
JMJD6Q6NYC1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
JMJD6Q6NYC1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JMJD6Q6NYC1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JMJD6Q6NYC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
JMJD6Q6NYC1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms