Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB12Q6IQ22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB12Q6IQ22 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB12Q6IQ22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB12Q6IQ22 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms