Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCERG1LQ5VWI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCERG1LQ5VWI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCERG1LQ5VWI1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCERG1LQ5VWI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCERG1LQ5VWI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
TCERG1LQ5VWI1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCERG1LQ5VWI1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCERG1LQ5VWI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms