Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACHD1Q5VU97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACHD1Q5VU97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACHD1Q5VU97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACHD1Q5VU97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACHD1Q5VU97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACHD1Q5VU97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACHD1Q5VU97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms