Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATPAF1Q5TC12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPAF1Q5TC12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATPAF1Q5TC12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPAF1Q5TC12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPAF1Q5TC12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms