Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL5A1-AS1Q5SY13 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms