Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SPECC1Q5M775 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPECC1Q5M775 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPECC1Q5M775 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPECC1Q5M775 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPECC1Q5M775 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SPECC1Q5M775 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPECC1Q5M775 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPECC1Q5M775 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms