Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL39P5Q59GN2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL39P5Q59GN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL39P5Q59GN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL39P5Q59GN2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms