Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TBRG1Q3YBR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TBRG1Q3YBR2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TBRG1Q3YBR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TBRG1Q3YBR2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TBRG1Q3YBR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms