Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDUFAF6Q330K2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDUFAF6Q330K2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDUFAF6Q330K2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDUFAF6Q330K2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFAF6Q330K2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFAF6Q330K2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms