Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CCDC27Q2M243 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC27Q2M243 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC27Q2M243 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC27Q2M243 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC27Q2M243 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms